换一批摘要目的 针对国内艰难梭菌毒素B(TcdB)基因型的生物信息学分析,并通过原核表达制备TcdB,为有效疫苗的开发提供数据支持.方法 利用多个生物信息学软件,如Snippy,Blast,Muscle,R语言下的dist.alignment()函数与hclust()函数,对NCBI Genbank数据库中中国境内的1 355株艰难梭菌基因组进行比对、分析,构建系统发育树,并对其TcdB进行分群、建树.使用在线生物信息学分析网站,对占比最大的TcdB1与TcdB2亚群的代表性菌株的蛋白质结构及抗原表位进行预测并分析.通过构建重组质粒,使用原核表达系统,纯化抗原蛋白TcdB.结果 根据TcdB的基因型,国内1 355株艰难梭菌大抵上可分为12个亚型,以TcdB1与TcdB2为主要亚型,占所有分离得到的菌株数量的93.94％以上;约17.20％的菌株为非产毒菌株或缺乏TcdB,单独表达艰难梭菌毒素A.TcdB1与TcdB2的抗原表位分布基本一致,多分布于蛋白C端重复组合寡肽结构域外.结论 成功建立了一种专门针对国内TcdB的分型系统,可对其主要亚型的代表性菌株进行抗原表位的预测,并对筛选后的TcdB进行重组表达制备.
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关键词
艰难梭菌毒素B序列分析生物信息学分析表位预测重组表达Clostridioides difficileToxin Bsequences analysisbioinformatics analysisepitopes predictionre-combinant expression
栏目名称
DOI
10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2025.12.010
发布时间
2026-01-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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