换一批重症监护病房耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药基因型及系统进化分析
Analysis of the antimicrobial resistance genotype and phylogenetic evolution of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae in the intensive care unit
摘要目的 通过分析某三甲医院重症监护病房(ICU)的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药基因及系统进化关系,为耐药菌防控的管理提供参考依据.方法 收集安徽医科大学第二附属医院2018年3―7月ICU住院病人分离的19株CRKP,使用VITEK-2 Compact系统进行细菌鉴定及药敏试验,应用Illumina Hiseq 2500平台进行全基因组测序(WGS),应用MLST软件测定ST型,应用Kaptive软件检测荚膜型,应用Staramr软件筛查菌株的耐药基因,应用Ridom SeqSphere+软件进行cgMLST分型及最小生成树(MST)的构建,并应用CSI Phylogeny 1.4软件及FigTree v1.4.4软件构建最大似然树(MLT),以分析其系统进化关系.结果 19株CRKP除了对替加环素敏感,对其他常用抗菌药物均呈现耐药,19株CRKP均携带blaKPC-2耐药基因,均属于ST11-KL64型,MST图中以AY7007、AY7003为中心聚集为一簇,cgMLST分型均为CT1774型,MLT图显示分为四组克隆型,组内亲缘性关系相近.结论 该院ICU分离的CRKP以ST11-KL64-CT1774型为主,并具有多重耐药性,存在医院内播散的风险.
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关键词
肺炎克雷伯菌碳青霉烯类抗药性,细菌重症监护病房耐药基因型系统进化分析Klebsiella pneumoniaeCarbapenemesDrug resistance,bacterialIntensive care unitAntimicrobial resistance genotypePhylogenetic evolution
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1009-6469.2023.08.025
发布时间
2023-07-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（81902056）
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