基于生物信息学鉴定溃疡性结肠炎和牙周炎的关键基因及其免疫浸润分析
Identification of hub biomarkers and immune cell infiltration in ulcerative colitis and periodontitis via bioinformatics analysis
摘要目的 越来越多的证据支持溃疡性结肠炎(UC)和牙周炎(PD)之间的双向关系,但其发生机制仍不清楚.该研究旨在确定UC和牙周炎共同的生物标志物,并探讨其与免疫细胞的关系.方法 从GEO数据库中下载UC和牙周炎数据集,通过差异表达分析和加权基因共表达网络分析(WGCNA)挖掘UC和牙周炎的共享基因,使用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)进行功能和通路富集分析.利用Cytoscape中的"cystoHubba"插件联合LASSO回归进一步筛选关键基因,并通过外部数据集验证其表达水平和诊断价值.最后,采用单样本基因集富集分析(ssGSEA)量化28个免疫细胞在样本中的浸润水平及其与关键基因的关系.结果 结合差异表达分析和WGCNA的结果,共鉴定出55个共享基因.cytoHubba鉴定出9个候选枢纽基因,进一步的LASSO回归分析显示,白细胞介素(IL)-1β和CXCR4是UC和牙周炎的最佳共享关键基因.与健康组织相比,UC和牙周炎组织中活化的CD4+T细胞、活化的B细胞、未成熟的B细胞、自然杀伤细胞、髓系抑制性细胞(MDSCs)和巨噬细胞的浸润明显高于健康组织.此外,关键基因与免疫浸润细胞之间的相关性表明,IL-1β和CXCR4的表达与MDSCs的浸润呈显著正相关.结论 MDSCs与UC和牙周炎的发病机制密切相关.IL-1β和CXCR4通过免疫相关信号通路可能参与UC和牙周炎的进展.
更多相关知识
- 浏览1
- 被引0
- 下载0

相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文


换一批



