换一批基于网络药理学和分子对接技术探究小柴胡汤治疗三阴性乳腺癌的作用机制
Mechanism of Action of Xiaochaihu Decoction in Treatment of Triple-negative Breast Cancer:An Analysis Based on Network Pharmacology and Molecular Docking
摘要目的 通过生物信息学分析和整合药物代谢动力学数据进行多重药物靶点预测,探究小柴胡汤治疗三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)的作用机制.方法 基于药理学数据库获取小柴胡汤的活性成分与对应靶点;采用加权基因共表达网络分析方法识别乳腺癌高通量测序数据中肿瘤发生发展的关键基因;采用GO功能与KEGG通路富集分析进行生物功能与通路注释;通过Cytoscape软件进行核心基因鉴定;利用分子对接方法模拟关键生物标志物与小柴胡汤核心活性成分的对接模式.结果 在对小柴胡汤进行数据挖掘后获得242个有效成分和265个对应靶点,通过加权分析方法得到乳腺癌密切相关的563个疾病关键靶点,小柴胡汤与TNBC共有13个交集靶点.小柴胡汤成分靶点网络构建得到槲皮素、山柰酚、异鼠李亭素、木犀草素、豆甾醇、β-豆甾醇、牵牛花色素等主要成分.PPI网络构建后通过筛选得到3个核心靶点(CCNA2、CCNB1、CHEK1)与2个关键化学成分(槲皮素、山柰酚).GO富集获得15个生物过程、45个细胞组分、16个分子功能,其中主要与细胞器裂变和细胞核分裂等细胞增殖过程,浓缩染色体和中心区核染色体,单链DNA结合ATP依赖活性等相关.KEGG通路富集得到了37条通路,主要富集在精氨酸等代谢通路上.分子对接模拟显示核心蛋白靶点与重要活性成分具有良好的结合活性.结论 小柴胡汤主要通过CCNA2、CCNB1、CHEK1等靶点,槲皮素、山柰酚等主要活性成分及细胞调亡、成纤维细胞形成和肿瘤细胞增殖及炎症进程达到干预TNBC的作用.
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关键词
三阴性乳腺癌加权基因共表达网络分析小柴胡汤网络药理学分子对接技术Triple-negative breast cancerWeighted gene co-expression network analysisXiaochaihu DecoctionNetwork pharmacologyMolecular docking
分类号
R737.9（泌尿生殖器肿瘤）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.2095-7246.2023.05.016
发布时间
2023-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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