换一批NOD样受体家族含CARD结构域5在胃癌中的相互作用蛋白及其对胃癌的诊断价值
Interaction proteins with NOD-like receptor family CARD domain containing 5 and their diagnostic value in gastric cancer
摘要目的 探究NOD样受体家族含CARD结构域5(NLRC5)在胃癌中的相互作用蛋白,并明确其对胃癌的诊断价值.方法 采用癌症基因组图谱(TCGA)数据库探究NLRC5在胃癌组织和癌旁组织中的差异,结合STRING网站分析NLRC5的相互作用蛋白,通过基因表达综合(GEO)数据库验证TCGA数据库筛选出来的蛋白对胃癌的诊断价值.引用临床模型,验证筛选出来的蛋白在胃癌组织和癌旁组织中的表达情况,确定各蛋白间的相关性,通过受试者工作特征(ROC)曲线明确其对胃癌的诊断价值.结果 TCGA结果显示,胃癌组织中NL-RC5表达水平明显高于癌旁组织(P﹤0.01).蛋白-蛋白相互作用发现,核因子κB激酶复合物抑制剂组分(CHUK)、核因子κB激酶亚单位β的抑制剂(IKBKB)、三重基序蛋白25(TRIM25)与NLRC5均呈正相关.经过GEO数据库验证得到TRIM25、CHUK、IKBKB与NLRC5可以构建联合模型诊断胃癌.临床模型中NLRC5在胃癌组织中高表达,且与TRIM25、IKBKB、CHUK表达水平均呈正相关(P﹤0.01).NLRC5联合TRIM25、IKBKB、CHUK对胃癌有较高的诊断价值.结论 TRIM25、IKBKB、CHUK参与NLRC5在胃癌发展中的相关调控机制,在胃癌诊断中具有较高的效能.
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关键词
癌症基因组图谱基因表达综合数据库NOD样受体家族含CARD结构域5胃癌相互作用蛋白诊断价值The Cancer Genome AtlasGene Expression Omnibus databaseNOD-like receptor family CARD do-main containing 5gastric cancerinteraction proteindiagnostic value
分类号
R735.2（消化系肿瘤）
栏目名称
DOI
10.11877/j.issn.1672-1535.2023.21.14.07
发布时间
2023-10-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
河北省卫生健康委医学科学研究重点课题（20181773）
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