换一批基于TCGA数据库探究SERPINA5在前列腺癌中的表达及临床意义
Expression and clinical significance of SERPINA5 in prostate cancer based on TCGA database
摘要目的:研究前列腺癌中关键基因的差异化表达,为前列腺癌的诊疗提供新的生物治疗靶点和理论依据.方法:从美国癌症基因组图谱(TCGA)中下载前列腺癌的相关基因数据,利用R软件筛选出在前列腺癌组织和癌旁组织中差异化表达的基因,并进行富集分析.利用STRING 11.0 构建差异基因所表达蛋白的互作网络图,并通过Cytoscape_v3.7.1 进一步筛选Hub基因,通过Oncomine数据库对Hub基因在前列腺癌中的表达进行验证得到关键基因,随后利用R软件对关键基因与临床数据进行统计分析,最终利用在线工具GEPIA对关键基因进行生存分析.结果:总共得到 551 个样本(其中癌旁组织样本 52个,癌组织样本499 个),筛选后得到463 个差异基因,其中呈现上调趋势的基因共265 个,下调198 个.富集分析后发现这些基因主要富集在顶体反应的调节、三酰甘油代谢过程,PPAR信号通路等,进一步筛选后得到 10 个Hub基因,与Oncomine数据库联合验证后得到关键基因SERPINA5,进行临床分析发现前列腺癌病人的SERPINA5 的表达水平与肿瘤分化程度、TNM分期以及无病生存率有关(P<0.05),而与年龄、人种以及总生存率的差异无关(P>0.05).结论:前列腺癌中存在大量差异基因可能对疾病的发生发展起到影响作用,其中 SERPINA5 也许可以作为前列腺癌早期筛查标志物或治疗的生物靶点,为前列腺癌的预防与治疗带来新的方案以及研究方向.
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分类号
R737.25（泌尿生殖器肿瘤）
栏目名称
DOI
10.13898/j.cnki.issn.1000-2200.2024.03.012
发布时间
2024-05-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
蚌埠医学院自然科学研究重点项目（BYKY2019035ZD）
安徽省高校自然科学研究重点项目（KJ2021A0819）
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