换一批基于加权基因共表达网络分析鉴定PE患者的潜在生物标志物
Identification of Potential Biomarkers in Patients with Preeclampsia Based on Weighted Gene Co-Expression Network
摘要目的:本研究旨在通过对子痫前期(PE)患者基因数据集进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),寻找PE的分子标志物.方法:从GEO数据库下载GSE10588表达数据集,该数据集包括17例PE患者和26例对照者的胎盘组织转录组数据.使用差异表达分析及WGCNA筛选与PE相关的重点差异表达基因(DEGs),利用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析来探索重点基因的生物学作用.构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络筛选关键枢纽基因,并通过风险预测模型和受试者工作特征(ROC)曲线评价这些枢纽基因对PE的预测效果.结果:共获得138个DEGs,其中包括100个上调和38个下调DEGs.通过WGCNA确定了23个与PE发病最相关的重点DEGs.GO和KEGG通路分析显示,这些重点DEGs在调节促性腺激素分泌、白细胞分化、造血功能、内分泌功能及B细胞的激活等生物学作用中发挥重要作用.在PPI网络中,卵泡抑素相关基因3(FSTL3)、酪氨酸激酶受体1(FLT1)、抑制素亚单位A(INHBA)、N-myc下游调节基因1(NDRG1)和瘦素(LEP)等成为节点最多的基因.风险预测和ROC曲线表明,FSTL3和LEP具有较高的风险得分和诊断价值.结论:FSTL3和LEP可以作为预测和诊断PE的生物标志物.
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关键词
子痫前期加权基因共表达网络分析生物标志物卵泡抑素相关基因3瘦素preeclampsiaweighted gene coexpression network analysis(WGCNA)biomarkersfollistatin-related gene 3(FSTL3)leptin(LEP)
分类号
R714.25（产科学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.2096-6113.2024.01.007
发布时间
2024-04-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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