我国首次发现的HIV-1和HIV-2双重感染样品中病毒部分基因的序列特征分析
Viral Sequence Analysis of HIV-1 and HIV-2 Dual Infection Firstly Found in China
摘要上海市卫生检疫局送检了一例HIV-1和HIV-2抗体检测均呈阳性的双重感染样品,对其感染的HIV前病毒的gag和env基因区进行了序列分析,首次阐明我国发现的HIV双重感染样品的HIV部分基因特征.从HIV感染者淋巴细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMC)中提取前病毒DNA,分别使用HIV-1和HIV-2特异性引物用套式PCR扩增HIV-1和HIV-2的部分基因区.PCR产物不经克隆直接测序,经GenBank检索并使用GCG软件包进行序列分析.结果表明,其中感染的HIV-2毒株中gag基因区与德国株HI2PEI2KR相似,基因离散率仅为8.1%,env基因C2-V3区与来自几内亚比绍的HIV-2U05358株最近,离散率为13.04%,在其gp36区发现与HIV-2U05358基因离散率为10.63%,两个毒株均属HIV-2中的A亚型.而其HIV-1型毒株在gag和env区都与从尼日利亚分离的H92NG083株相似,属HIV-1的G亚型.本文首次对我国发现的HIV-2型毒株进行了主要基因区的序列分析,表明在非洲较常见的HIV-2A亚型和HIV-1G亚型毒株,已随援外劳工传入我国.
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