2003～2007年中国风疹病毒基因特征分析

Genetic Characterization of Chinese Rubella Virus Isolates from 2003 to 2007

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摘要本研究用Vero细胞或Vero/SLAM细胞从我国10个省(直辖市、自治区,下同)2003～2007年风疹暴发和散发病例的咽拭子标本中分离到57株风疹病毒,用RT-PCR方法扩增了57株风疹病毒E1基因1 107个核苷酸的片段,并对该PCR产物进行序列测定和分析.结果提示,在基于WHO基因定型靶序列739个核苷酸片段构建的基因亲缘关系树上,其中55株风疹病毒株属于1E基因型,相对于其他国家的1E基因型,形成一个独立分支;另外2株风疹病毒属于2B基因型.57株风疹病毒大部分核苷酸的突变为无义突变,氨基酸序列高度保守,除了2株风疹病毒在E1蛋白血凝抑制和中和位点区域第212位氨基酸由Thr变为Ser,其他病毒株均无重要抗原位点的改变;所有我国已分离到的1E基因型风疹病毒在E1蛋白第338位氨基酸共享突变位点(Leu338→Phe338),而其他基因型以及其他国家的1E基因型风疹病毒在该位点均未发生突变,提示该氨基酸(Phe338)可能是我国1E基因型风疹病毒所特有.2003～2007年在我国10个省均分离到1E基因型,而2B基因型只在2006年从四川省的越南输入病例中分离到,提示1E为绝对优势基因型,2B基因型为输入基因型.与1979～1984年和1999～2002年我国流行的风疹基因型不同,发生了基因型的更替,近年我国风疹的流行是由1E基因型为主的风疹野病毒的多个传播链引起.

作者朱贞 ^[1] 许文波 ^[2] 毛乃颖 ^[2] 蒋小泓 ^[2] 许松涛 ^[2] 何吉兰 ^[3] 孙莉 ^[3] 凌华 ^[4] 张珍英 ^[5] 李聪勇 ^[5] 巴卓玛 ^[6] 詹军 ^[7] 陈慧 ^[7] 王飞霞 ^[8] 周淑洁 ^[9] 陈霞 ^[9] 郑蕾 ^[10] 戴德芳 ^[11] 张红 ^[11] 梁勇 ^[12] 学术成果认领

作者单位 北京协和医学院,北京,100730;中国疾病预防控制中心,病毒病预防控制所,北京,100052 ^[1] 中国疾病预防控制中心,病毒病预防控制所,北京,100052 ^[2] 四川省疾病预防控制中心,成都,610031 ^[3] 重庆市疾病预防控制中心,重庆,400042 ^[4] 河南省疾病预防控制中心,郑州,450003 ^[5] 青海省疾病预防控制中心,西宁,810000 ^[6] 宁夏自治区疾病预防控制中心,银川,750004 ^[7] 江西省疾病预防控制中心,南昌,330029 ^[8] 安徽省疾病预防控制中心,合肥,230061 ^[9] 山西省疾病预防控制中心,太原,030012 ^[10] 湖南省疾病预防控制中心,长沙,410057 ^[11] 河北省疾病预防控制中心,石家庄,050021 ^[12]

关键词风疹病毒基因特征基因型

主题词基因型(Genotype)基因(Genes)风疹病毒(Rubella virus)风疹(Rubella)提示(Cues)

分类号 R373.1

栏目名称论著

DOI 10.3321/j.issn:1000-8721.2008.01.002

发布时间 2008-04-29

基金项目

WHO EPI项目 卫生部疾病控制司科研项目