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长春地区轮状病毒流行株VP7基因的遗传变异

Genetic Variation in VP7 Gene of Rotavirus Serotype G3 Predominated in Changchun, China

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摘要A组轮状病毒是引起婴幼儿秋冬季病毒性腹泻的主要病原.目前没有有效的治疗药物,应用安全而有效的疫苗是控制重症腹泻的首要措施.对当地A组轮状病毒流行株的主要中和抗原VP7的编码基因进行遗传变异分析,可以为疫苗的应用和开发提供有益的指导.利用ELISA方法对长春地区1999～2005年的腹泻患儿标本检测A组轮状病毒,RT-PCR方法对阳性标本进行G血清分型,发现长春地区2001年以后流行的轮状病毒以G3型血清为主.选取1999～2005年的G3型轮状病毒标本31份,对其VP7基因进行扩增、克隆、测序,经过计算机分析比对,31株G3型轮状病毒VP7基因核苷酸序列没有显著差异.同一流行季节的毒株具有较相似的遗传变异特征.在2003年轮状病毒流行季节内,有6株G3型分离株的VP7基因在碱基1 038位置上出现一个碱基缺失.毒株发生在A、B、C三个高变区的碱基突变,位点相同或者位置临近.2002年以后毒株的基因突变增加,非高变区的碱基变异增加,这可能有助于维持G3型轮状病毒成为流行株.有规律的变异多发生在高变区,但是非高变区的非连续性变异的增加值得引起注意.

作者王端可 ^[1] 章青 ^[2] 孙利炜 ^[3] 王承训 ^[3] 段招军 ^[2] Xi Jiang ^[4] Baoming Jiang ^[5] 方肇寅 ^[2] 学术成果认领

作者单位中国疾病预防控制中心,病毒病预防控制所,北京,100052;北京市顺义区医院,北京,101300 ^[1] 中国疾病预防控制中心,病毒病预防控制所,北京,100052 ^[2] 长春市儿童医院,吉林,长春,130061 ^[3] 辛辛那提儿童医院医学中心,美国 ^[4] 美国疾病预防控制中心,美国 ^[5]

关键词轮状病毒 RT-PCR VP7基因遗传变异

医学主题词病毒(Viruses)基因(Genes)遗传变异(Genetic Variation)疫苗(Vaccines)腹泻(Diarrhea)

分类号 R373.2（医学微生物学《病原细菌学、病原微生物学》）

栏目名称

论著

DOI 10.3321/j.issn:1000-8721.2008.01.004

发布时间 2008-04-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

基金项目

美国国立卫生研究院项目（V27/181/123;R03TW01192）国家自然科学基金（30270069）美国PATH项目（GAV.1142-01-07228-LPS）