山西省2014年Ⅱ型疫苗衍生脊髓灰质炎病毒的基因特性分析
Genetic Characteristics of Type 2 Vaccine-derived Poliovirus in Shanxi Province (China) in 2014
摘要2010年世界卫生组织(World Health Organization,WHO)对Ⅱ型疫苗衍生脊髓灰质炎(脊灰)病毒(Vaccinederived Poliovirus,VDPV)定义进行了修订,为研究新定义的Ⅱ型VDPV的基因特征及进化,本研究对山西省2014年1例急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例中分离到的1株Ⅱ型VDPV进行全基因组序列测定和分析.测序显示毒株的基因全长为7 439个碱基,共编码2207个氨基酸,与Sabin2疫苗株相比不存在碱基的插入和缺失.该毒株在已知的减毒位点5'非编码区nt481上发生了回复突变,而在另一个减毒位点VP1衣壳编码区nt2909位点上未发生核苷酸变异.毒株与Sabin1发生重组,重组位点位于3D非结构编码区的nt6 247~6 281之间.VP1编码区基因进化树分析表明山西Ⅱ型VDPV的进化独立于国内外至今发现的其它Ⅱ型VDPVs,按照脊灰已知的基因进化速率估算该毒株已在人群中循环约176d.本研究再次证明了中国脊灰实验室网络监测的敏感性,能够及时准确地发现VDPV,在中国维持无脊灰状态过程中发挥重要作用.
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