辽宁省水痘-带状疱疹病毒K、H、M、L糖蛋白基因特征分析
Analysis of gK,gH,gM,and gL Glycoprotein Genes of Varicella-Zoster Virus in Liaoning Province,China
摘要为研究辽宁省水痘-带状疱疹病毒(Varicella zoster virus,VZV)gK、gH、gM、gL四种糖蛋白基因特征,应用聚合酶链(Polymerase chain reaction,PCR)方法对辽宁省2017-2020年31株VZV gK、gH、gM、gL四种糖蛋白进行全基因扩增,并对扩增产物进行序列测定,分析不同位点核苷酸及氨基酸的变异情况.辽宁省31株VZV与v-Oka疫苗株(AB097932)相比,LN-VZV gK、gH、gM、gL共有16个位点发生核苷酸突变,导致氨基酸发生同义突变12处,错义突变4处.导致氨基酸发生错义突变包括:1株在4490位点发生A→G的碱基突变,导致编码氨基酸由I→T;1株在4730位点发生C→T的碱基突变,导致编码氨基酸由R→K;3株在67528位点发生A→G的碱基突变,导致编码氨基酸由I→M;1株在101579位点发生A→C的碱基突变,导致编码氨基酸由L→R.与Dumas株(X04370)相比,31株LN-VZV和v-Oka疫苗株在gL的101623-101624位点发生ATC的碱基插入,导致VZV gL内插入一个甲硫氨酸.31株LN-VZV与GenBank中各基因型VZV代表株相比核苷酸和氨基酸的同源性均大于98.10%.辽宁省VZV gK、gH、gM、gL基因序列高度保守,抗原性稳定,本研究首次对辽宁地区VZV糖蛋自序列进行测序分析,为辽宁省VZV的监测、疫苗效果评估及VZV进一步研究提供实验室依据.
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