换一批肠出血性大肠埃希菌O157:H7紧密黏附素C300与LTB融合蛋白B细胞表位预测
Predication of the Secondary Structure and B Cell Epitopes for the Fusion Protein of Intimin C300 and LTB in EHEC O157:H7
摘要目的 对肠出血性大肠埃希菌O157:H7紧密黏附素C300与黏膜佐剂不耐热肠毒素(LTB)融合蛋白二级结构及B细胞识别表位进行预测,为开发新型疫苗提供理论依据.方法 采用DNA star软件中的Protean预测软件对Intimin C300与LTB融合蛋白的亲水性指数、β-转角、柔韧性、表面可及性和抗原指数进行预测.结果 在融合蛋白N端第1-10、20-30、110-120、210-220、300-310、350-360、380-390和415-420区段可能是α-螺旋中心,在N端第195-205、300-320、335-350和390-410区段形成4个大的β-折叠中心区域,在各β-折叠区间存在均匀且较丰富的转角区域.融合蛋白的蛋白柔性区域可能位于N端第20-35、52-65、75-85、105-115、150-160、172-188、260-275和372-388区域,这些区域有一定幅度的折叠或摆动,可形成较复杂的三级结构.亲水性区域位于第50-60、70-80、155-165、190-200、240-250、270-270、330-340和375-385区段,这8个区域作为抗原表位可能性大.结论 通过生物信息学技术分析,可有效地预测融合蛋白二级结构和B细胞表位,为人工合成优势肽段进行肠出血性大肠埃希菌O157:H7的重组疫苗研制提供理论依据.
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分类号
R285.5（中药学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1009-4822.2011.03.011
发布时间
2011-11-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
吉林省科技发展计划（20080513）
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