单细胞转录组联合芯片分析探讨RETN/TLR4/CAP1在糖尿病牙周炎中的促炎机制
Single-cell transcriptomics combined with microarray analysis reveals the pro-inflammatory mechanism of RETN/TLR4/CAP1 in diabetic periodontitis
摘要目的 通过单细胞转录组和芯片数据集的联合分析,探讨糖尿病牙周炎中可能的促炎机制.方法 对GEO数据库中的数据进行整合生物信息学分析,获取糖尿病牙周炎的差异基因、免疫细胞浸润类型、功能富集通路以及显著互作配受体蛋白,筛选出参与糖尿病牙周炎的关键基因.结果 在对两个GEO数据集的整合分析中,发现RETN在糖尿病牙周炎组显著高表达,表明其可能是糖尿病牙周炎发生发展的关键生物标志物.细胞通讯分析结果表明,单核细胞来源的RETN可通过与T细胞、B细胞、单核细胞以及自然杀伤细胞上的TLR4和CAP1 受体相互作用,从而促进糖尿病牙周炎时的局部炎症反应.qRT-PCR实验验证了RETN在糖尿病牙周炎患者外周血中高表达.结论 RENT在糖尿病牙周炎中表达升高,其可能通过与TLR4 和CAP1 相互作用,促进糖尿病牙周炎中的炎症反应,加重糖尿病牙周炎的损伤,这为糖尿病牙周炎的治疗提供了新的靶点与思路.
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