换一批类风湿关节炎患者尿液外泌体生物学信息分析
A Bioinformatic Analysis of Urinary Exosomes in Patients with Rheumatoid Arthritis
摘要目的 探讨不同严重程度的类风湿关节炎患者尿液外泌体的差异蛋白并进行生物学信息分析.方法 收集48例类风湿关节炎患者尿液样本,根据DAS-28评分分为4组,应用超速离心技术提取尿液外泌体,采用蛋白组学Label-Free分析技术进行外泌体蛋白筛选、鉴定和分析,应用R语言进行差异蛋白分析.结果 4组共鉴定出2525个外泌体蛋白,采用t检验法进行差异分析,P＜0.05,差异系数大于1.5倍,筛选出轻度活动组vs缓解组中上调蛋白有465个,下调蛋白462个;中度活动组vs缓解组中上调蛋白有437个,下调蛋白360个;重度活动组vs缓解组中上调蛋白有669个,下调蛋白265个.基因本体论(Gene Ontology,GO)分析表明,所有差异表达蛋白明显富集的生物过程(BP)包括伤口愈合、补体激活等;细胞成分(CC)包括囊泡腔、细胞质囊泡腔等;分子功能(MF)中包括钙粘蛋白结合、磷脂结合等.共有差异蛋白的生物过程包括体液免疫反应、补体激活等;细胞成分包括血微粒、囊泡腔等,分子功能包括抗原结合、免疫球蛋白受体结合等.KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分析表明所有差异蛋白主要富集在肌动蛋白细胞骨架的调节、补体和凝血级联等过程.共有差异蛋白主要在金黄色葡萄球菌感染过程富集,同时也在补体和凝血级联过程中富集.结论 不同活动度类风湿关节炎患者相比较的差异蛋白与补体激活有关,可能成为监测类风湿关节炎活动度的生物学标志物.
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分类号
R593.22
栏目名称
DOI
10.11748/bjmy.issn.1006-1703.2024.10.009
发布时间
2024-12-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
首都医科大学附属北京世纪坛医院十四五领军人才培养项目（2023LJRCZM）
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