换一批1株临床分离的杂合子隐球菌株生物学及基因组学特征分析
An Analysis of the Biological and Genomic Features of a Clinically Isolated Interspecific Hybrid Cry ptococcus Strain
摘要目的 对 1 株临床分离的隐球菌进行准确菌种鉴定,并深入分析其生物学表型、抗真菌药物敏感性及全基因组特征,为临床诊疗和病原体溯源提供依据.方法 采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOFMSMALDI-TOF MS)对菌株进行初步鉴定.通过全基因组二+三代测序技术绘制其基因组图谱,并利用生物信息学方法分析其基因组学特征.采用 PCR 扩增特异引物方法检测隐球菌的血清型.使用 ATB FUNGUS3 微量肉汤稀释法检测该菌株对常用抗真菌药物的最低抑菌浓度.结果 质谱鉴定结果确认该菌株为隐球菌.基因组学分析揭示该菌株为 1 株杂合子,其基因组来源于 Cryptococcus neoformans var.grubii和Cryptococcus neoformans var.neoformans 的种间杂交,血清型为 AαDα型.药敏试验显示,该菌株对氟康唑中介、对临床常用 5 种抗真菌药物均为野生型菌株.基因组中发现了与唑类药物耐药相关的 CYP5 1 基因突变和新的荚膜多糖相关致病基因.结论 本研究成功鉴定并分析了 1 株临床来源的血清型为 AαDα杂合子隐球菌.该菌株具有独特的杂交基因组背景,其耐药性可能与特定的基因突变有关,其特殊致病性可能与新的荚膜多糖相关致病基因相关.本研究提示在临床实践中对隐球菌进行精准菌种鉴定的重要性,此类杂合菌株可能对治疗及预后产生影响.
更多相关知识
- 浏览3
- 被引0
- 下载2
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
