换一批
换一批蛋白激酶CK2天然产物类抑制剂的定量构效关系研究
Quantitative structure-activity relationship studies on natural product inhibitors of protein kinase CK2
摘要目的 构建CK2天然产物类抑制剂的定量构效关系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)模型,揭示影响该类抑制剂活性的结构因素,为新型CK2抑制剂的开发提供理论基础和实验依据.方法 基于文献报道的115个多骨架CK2天然产物类抑制剂,采用遗传算法(genetic algorithm,GA)联合多元线性回归(multiple linear regression,MLR)方法,建立了基于优选的Dragon描述符的QSAR模型,以留一法交叉验证系数Q2LOO以及相关系数R2作为模型内部验证的评价指标;通过Q2ext和R2ext评估模型的外部预测能力.结果 最优2D-QSAR模型由8个描述符组成,基于训练集内部验证的统计学参数为Q2Loo=0.7914、R2=0.8220;基于测试集外部验证的统计学参数为Q2ext=0.7921、R2ext=0.7998,表明该模型具有较高的可靠性和预测能力.结论 影响CK2天然产物类抑制剂活性的分子描述符包括IVDE、CATS2D_08_DA、nArX、IC1、Chi_D/Dt、SdssC、F08[C-O]以及C-006.本研究可为新型CK2抗癌抑制剂的发现提供实验指导.
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