• 医学文献
  • 知识库
  • 评价分析
  • 全部
  • 中外期刊
  • 学位
  • 会议
  • 专利
  • 成果
  • 标准
  • 法规
  • 临床诊疗知识库
  • 中医药知识库
  • 机构
  • 作者
热搜词:
换一批
论文 期刊
取消
高级检索

检索历史 清除

医学文献>>
  • 全部
  • 中外期刊
  • 学位
  • 会议
  • 专利
  • 成果
  • 标准
  • 法规
知识库 >>
  • 临床诊疗知识库
  • 中医药知识库
评价分析 >>
  • 机构
  • 作者
热搜词:
换一批

利用二代测序数据探索SPRY基因家族与中国人群非综合征型唇腭裂的关联

Exploring the association between SPRY gene family and non-syndromic oral clefts among Chinese populations using data of a next-generation sequencing study

摘要目的:探索SPRY基因家族中的单核苷酸多态性及亲源效应与中国人群非综合征型唇腭裂发病风险的关联.方法:研究基于病例-双亲设计,以2016-2018年于北京大学口腔医院募集的183个中国人群非综合征型唇裂合并或不合并腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCI/P)核心家系(549人)为研究对象.利用其二代测序数据中的SPRY基因家族相关信息,展开单核苷酸多态性和亲源效应分析.该测序研究采用二阶段设计,第一阶段对24个家系进行全外显子组测序探索潜在阳性信号,第二阶段在159个家系的独立样本中对第一阶段结果进行验证.采用问卷调查收集NSCL/P患者及其父母的基本情况、患病情况、临床特征及孕期环境暴露等信息.收集患儿及其父母的血液并提取DNA进行基因检测以获取遗传信息.单核苷酸多态性分析采用传递不平衡检验,亲源效应分析采用Z检验,统计分析使用PLINK(vl.07)软件完成.第一阶段的多位点分析采用以家系为基础的序列核心关联检验方法,由R软件(v3.5.1) famSKAT-RC包完成.采用Bonferroni法对验证结果进行多重检验校正.结果:经过质量控制,第一阶段共有22个SPRY基因家族的位点纳入分析,结合位点的注释、功能预测结果及统计检验结果,纳入rs1298215244(SPRY1)和rs504122 (SPRY2)两个位点进入二阶段验证.二阶段传递不平衡检验发现,rs1298215244:T>C、rs504122:G>C两种常见变异以及rs504122:G>T罕见变异与NSCL/P的关联达到Bonferroni多重检验校正后的显著性水平,位于SPRY1的rs1298215244:T>C其亲源效应矫正前具有统计学意义,但未能通过多重检验校正.结论:发现SPRY基因家族中的单核苷酸多态性与中国人群NSCL/P的发病风险存在关联,但未发现SPRY基因家族具有亲源效应.

更多
广告
  • 浏览164
  • 下载60
北京大学学报(医学版)

北京大学学报(医学版)

2019年51卷3期

564-570页

MEDLINEISTICPKUCSCDCA

加载中!

相似文献

  • 中文期刊
  • 外文期刊
  • 学位论文
  • 会议论文

加载中!

加载中!

加载中!

加载中!

特别提示:本网站仅提供医学学术资源服务,不销售任何药品和器械,有关药品和器械的销售信息,请查阅其他网站。

  • 客服热线:4000-115-888 转3 (周一至周五:8:00至17:00)

  • |
  • 客服邮箱:yiyao@wanfangdata.com.cn

  • 违法和不良信息举报电话:4000-115-888,举报邮箱:problem@wanfangdata.com.cn,举报专区

官方微信
万方医学小程序
new翻译 充值 订阅 收藏 移动端

官方微信

万方医学小程序

使用
帮助
Alternate Text
调查问卷