摘要目的 探讨HLA新等位基因C*15:279的核苷酸和氨基酸序列的变化、其编码蛋白分子的三维空间结构模型及其产生的分子机制.方法 选取中华骨髓库中申请造血干细胞移植的汉族男性患者.利用PCR直接测序(poly-merase chain reaction-sequence-based typing,PCR-SBT)技术、等位基因组特异性引物PCR技术和第三代测序(third gen-eration sequencing,TGS)技术对C*15:279的序列进行鉴定,分析其与最相近的等位基因HLA-C*15:02:01:01的核苷酸和氨基酸的差异.应用SWISS-MODEL软件进行氨基酸位置差异分析并同源建模,对该基因所编码的蛋白分子三维结构进行模拟分析.通过对变异核苷酸序列片段的溯源分析,探讨其新基因形成的分子机制.结果 与同源性最高的HLA-C*15:02:01:01序列相比,新等位基因HLA-C*15:279共有5个碱基突变,即第4外显子的第727、735、756位发生C>T、C>G、C>T的替代和第5外显子的第900、982位发生A>G的替代,导致第219、221、228、276、304位密码子发生CGG>TGG、GGC>GGG、ACC>ACT、CCA>CCG、ATG>GTG的改变,其中第219位密码子编码的氨基酸由精氨酸变为色氨酸,第304位密码子编码的氨基酸由甲硫氨酸变为缬氨酸,其余位置的氨基酸未发生改变.蛋白分子三维结构模拟分析结果显示,两个氨基酸变异分别位于α3结构域中α螺旋与β折叠片之间的连接环部位和跨膜区中部.序列溯源分析结果显示,HLA-C*15:279中包含第4和第5外显子所有突变核苷酸的核酸序列(密码子219-304的基因区域)与等位基因C*03:03:01:01/03:04:01:01对应的核酸序列相同.结论 该基因序列被WHO HLA命名委员会正式命名为HLA-C*15:279.分析预测此编码氨基酸残基的改变将可能影响其与抗原肽及CD8+T细胞表面的T细胞受体的结合特性及细胞内信号传导.该新等位基因可能是通过基因转化机制而形成的.