甲状腺乳头状癌组织中差异表达miRNA及其靶基因的筛选和预测

Screening and prediction of differential expression miRNA and their target genes in papillary thyroid carcinoma tissue

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摘要目的:分析甲状腺乳头状癌组织中差异表达小分子RNA (miRNAs)并预测其靶基因,寻找影响甲状腺乳头状癌(PTC)发生发展及可用于生物标志物的miRNAs.方法:选取经病理证实的甲状腺乳头状癌组织及配对正常组织切除标本,运用高通量基因芯片的方法对差异表达的基因和miRNAs进行筛选,采用KEGG通路分析差异表达基因的功能,通过预测网站对差异表达miRNA进行靶基因预测,并对分析结果进行qRT-PCR验证.结果:与同源正常组织比较,基因芯片检测出PTC组织有248个miRNAs (P＜0.01)和3 631个基因差异表达(P＜0.05).hsa-miR-101[靶基因:整合素3(ITGA3)]已验证,癌组织中hsa-miR-101表达(59.8％)低于正常甲状腺组织,ITGA3表达(100％)高于正常甲状腺组织,并且与正常组织比较,59.8％PTC组织hsa-miR-101表达下调,同时ITGA3表达上调.结论:hsa-miR-101的靶基因可能为ITGA3,两者在PTC的发生发展中可能发挥重要作用.