四种不同方法提取人粪便细菌基因组脱氧核糖核酸的比较
Comparison of bacterial genomic DNA extraction from human feces in four different methods
摘要目的:比较四种方法提取人粪便细菌基因组DNA 的效果。方法:收集30例健康受试者的粪便,采用改进的氯仿抽提法、改进的十六烷基三甲基溴化铵(cetyl trimethyl ammonium bromide ,CTAB)法、改进的液氮冻融法及粪便基因组脱氧核糖核酸(deoxyri‐bonucleic acid ,DNA)试剂盒法提取 DNA ,通过微量紫外分光光度计对总产量和纯度进行分析。并选择 V3区配对的引物,PCR 扩增细菌16S rDNA基因序列,比较不同方法提取人粪便基因组DNA 效率的差异。结果:采用改进的氯仿抽提法、改进的CTAB 法、改进的液氮冻融法提取和粪便基因组DNA 试剂盒法提取的DNA 浓度分别为(91.05±58.35)ng/μL、(7.06±3.25)ng/μL、(784.00±69.13)ng/μL、(209.98±39.30)ng/μL ,四组两两比较,差异具有统计学意义( P <0.01)。结论:粪便基因组DNA试剂盒法在提取的基因组 DNA纯度、PCR产物扩增电泳,耗时等方面均优于其他三种方法。但改进的氯仿抽提法、改进的 CTAB 法、改进的液氮冻融法的优点是满足后期使用条件的前提下,提取费用相对较低。
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