换一批子宫内膜癌肿瘤微环境中预后相关基因的生物信息学分析及表达谱分析
Bioinformatics analysis and expression profile analysis of prognostic related genes in the tumor microenvironment of endometrial carcinoma
摘要目的:结合生物信息学分析和PCR表达验证,探索子宫内膜癌(endometrial carcino-ma,EC)肿瘤微环境中的预后关键基因.方法:下载获取TCGA数据库中552 例EC患者的基因表达数据,应用R软件ESTIMATE算法进行免疫评分和基质评分,筛选表达差异基因.多种算法对差异基因的预后情况和相关通路进一步探索.PCR实验分析差异基因在细胞系中的表达相关性.结果:Cox回归分析和KM生存分析提示CCR4(C-C motif chemokine receptor 4,CCR4)为潜在预后相关基因.GSEA(gene set enrichment analysis,GSEA)、KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析结果发现,CCR4 在免疫应答-激活细胞表面受体信号通路中显著富集.RT-qPCR结果表明,在细胞水平,CCR4 在肿瘤组的表达显著高于非肿瘤组.结论:子宫内膜癌的肿瘤微环境中存在免疫浸润,CCR4 有望成为新的子宫内膜癌诊断标记物.
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关键词
肿瘤微环境子宫内膜癌生物信息学分析预后基因Tumor microenvironmentEndometrial carcinomaBioinformatics analysisPrognostic gene
栏目名称
DOI
10.16833/j.cnki.jbmc.2024.07.001
发布时间
2024-08-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（82201820）
安徽省教育厅自然科学研究重点项目（2022AH051243）
皖南医学院中青年科研基金项目（WK202215）
皖南医学院自然科学研究重点项目（WK2022Z03）
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