换一批
换一批基于生物信息学分析对结直肠癌与不同距离癌旁组织的基因差异表达的探讨
The differential gene expression and mechanism of colorectal cancer and adjacent tissues at different distances based on bioinformatics analysis
摘要目的:通过生物信息学分析,探讨结直肠癌与不同距离癌旁组织中的基因差异表达的机制.方法:通过Illumina Novaseq 6000 测序平台对所选标本进行真核mRNA测序.结果:表达量差异分析显示,在结直肠癌上缘组中差异表达基因共 28 000 个,其中上缘差异表达上调基因 11 735 个,差异表达下调基因 16 265 个;在结直肠癌下缘组中差异表达基因共 32 438 个,其中差异表达上调基因11 477 个,差异表达下调基因20 961 个.表达量差异火山图筛选出结直肠癌组织和不同距离癌旁组织中共有的下调基因有IGF2BP1、ADAM12、CDON、AKAP6、IGSF9 B、LONR2、KCNB1.差异基因功能注释分析显示,差异基因主要参与细胞过程,参与的通路主要有新陈代谢、信号转导及免疫系统等.在发病机制方面主要存在于癌症方面、神经系统疾病及胃肠系统疾病等.差异基因富集分析显示,差异基因主要在心脏传导、胶原纤维组织、胶原蛋白分解过程等,富集的通路主要为人乳头病毒感染通路及 P13K-Akt 信号通路等.结论:差异基因IGF2BP1、ADAM12、CDON、AKAP6、IGSF9 B、LONR2、KCNB1 在结直肠癌组织与不同距离癌旁组织中表达下调.差异基因存在于细胞中,主要参与新陈代谢通路、信号转导通路及免疫系统通路.发病机制方面主要存在于癌症方面、神经系统疾病及胃肠系统疾病等.
更多相关知识
栏目名称
DOI
10.16833/j.cnki.jbmc.2025.01.001
发布时间
2025-03-05
基金项目
国家自然科学基金（82060337）；
深圳市龙岗区医疗卫生科技计划项目（LGKCYLWS2021000033）；
深圳市龙岗区医疗卫生科技计划项目（LGKCYLWS2023025）；
深圳市科技计划计划项目（JCYJ20220531092412028）；
深圳市科技计划计划项目（JCJY20230807121306012）
- 浏览6
- 被引0
- 下载1
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
