换一批基于WGCNA识别与肺腺癌预后相关的关键基因
Analysis of hub genes associated with lung adenocarcinoma prognosis based on WGCNA
摘要目的:利用生物信息学识别与肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)发生发展相关的关键基因,并探讨其在LUAD生存预后中的潜在应用价值.方法:基于癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中的转录组数据,利用R语言软件筛选LUAD癌组织与癌旁正常组织基因的差异表达情况,并对其进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因和基因组数据库(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)的富集分析;利用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)识别 TCGA 数据库中 LUAD 数据集的关键模块及其基因;利用Kaplan-Meier分析和比例风险回归模型分析与LUAD预后有关的预测因子.结果:基于TCGA基因表达数据共筛选1 749个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs).通过WGCNA识别TCGA数据库中LUAD基因表达数据的关键模块,鉴定出蓝色、棕色、青绿色、黄色和绿色模块与LUAD发生发展相关(r=0.69、r=0.42、r=-0.65、r=-0.41、r=-0.30,P＜0.01).通过整合DEGs和关键模块及其基因,最终筛选了 3个关键基因,即CDK1、DLGAP5和PLK1,且上述基因的过表达均与LUAD患者的不良预后有关(P＜0.05).结论:CDK1、DLGAP5和PLK1与LUAD的预后不良相关,可作为改善LUAD预后的潜在治疗靶点.
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关键词
肺腺癌生物信息学加权基因共表达网络分析关键基因Lung adenocarcinoma(LUAD)BioinformaticsWeighted gene co-expression network analysisHub genes
栏目名称
DOI
10.16833/j.cnki.jbmc.2025.10.007
发布时间
2025-12-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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