基于网络药理学分析及分子对接探究玉屏风散促进创口愈合机制
Wound healing mechanism of Yupingfeng Powder based on network pharmacological analysis and molecular docking
摘要目的 通过网络药理学及分子对接对玉屏风散药物成分、作用靶点进行数据挖掘、分析,以探究玉屏风散促进创口愈合的作用机制.方法 TCMSP检索玉屏风散有效成分、相关靶点,使用GeneCards、OMIM、PharmGKB、TTD、Drug-Bank数据库检索疾病相关靶点,使用Perl语言进行归类数据分析.R语言绘制Venn图.STRING网络平台检索靶蛋白之间相互关系,并导出PPI网络图,使用Cytoscape软件将药物有效成分及疾病相关靶点网络关系可视化.使用Biocon-ductor数据、R语言进行数据分析并绘制相关柱状图、气泡图、通路图.使用PubChem数据库、PDB数据库受体、配体信息,通过AutoDockTools进行分子对接、打分.结果 筛选出玉屏风散中有黄芪14种,防风16种,白术3种有效成分.PPI中筛选出18个核心靶点.GO及KEGG分析,AGE-RAGE通路、TNF通路、EGFR通路、PI3K-Akt通路、MAPK通路、HIF-1通路与玉屏风散促进创面愈合相关.玉屏风散有多种有效成分作用于核心靶点PPARγ,预测有效成分常春藤皂苷元可能作用于PPARγ 靶点.结论 玉屏风散通过多靶点、多途径和多重机制促进创口愈合.常春藤皂苷元可能是作用于PPARγ靶点促进创面愈合的新机制.
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