换一批
换一批蒺藜苜蓿全基因组中 U-box 基因家族的筛选与特征分析
Genome-wide screening and characterization of the U-box gene family in Medicago truncatula
摘要植物基因组中广泛存在 U-box 基因，其编码蛋白大部分作为泛素系统中决定底物特异性识别的 E3泛素连接酶，广泛地调控植物生长生殖发育以及响应逆境胁迫等过程。本文利用蒺藜苜蓿基因组数据库，通过生物信息学手段，鉴定蒺藜苜蓿 U-box 家族基因；采用 MEGA6软件进行系统进化树分析；通过 GSDS 在线工具和 Mapinspect软件进行基因结构及染色体定位分析；利用已有的蒺藜苜蓿芯片数据进行组织表达和胁迫响应表达分析。结果表明，蒺藜苜蓿基因组中含有41个 U-box 基因，不均匀地分布于蒺藜苜蓿的8条染色体上。根据结构域组成和系统进化分析将这些 U-box 蛋白分成6类。基因表达模式分析发现，该家族成员的表达具有一定的组织特异性，并能响应盐、干旱和氮素胁迫。这些研究结果为蒺藜苜蓿 U-box 基因家族的功能分析奠定了基础。
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关键词
蒺藜苜蓿U-box 基因家族进化表达模式Medicago truncatulaU-box gene familyphylogenetic analysisexpression patterns
栏目名称
研究论文
DOI
10.11686/cyxb2015102
发布时间
2015-09-07
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