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miR-223基因家族的分子进化与靶基因预测

Molecular evolution of miR-223 gene family and prediction of their target genes

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摘要目的：分析所有 miR-223基因家族成员的序列特征，并对 miR-223靶基因进行预测，然后分析 miR-223靶基因的生物学功能。方法：利用 Clustal X 1．83软件分析 miR-223基因序列特征，MEGA 5．0软件分析进化关系，再运用 Tar-getScan、PicTar 和 miRDB 进行靶基因预测，最后 GO 和 KEGG 进行功能分析。结果：在 miRBase 数据中获得 miRNA-223基因家族成员的序列27条，绝大部分位于基因间隔区，少数成员的基因位置未知。大部分定位于 X 染色体，部分成员位于常染色体。miRNA-223成熟序列长度在20-23nt 之间，同源性较高。系统进化树分析表明，miRNA-223基因家族成员分为三支。预测获得人类 miRNA-223的可能具有27个靶基因，它们主要与信号转导、转录调控以及细胞生长发育等密切相关。结论：本研究结果不仅有利于理解 miR-223基因家族的生物学功能，也可为后续研究提供理论依据。