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斑马鱼cldn3d基因的生物信息学特征及基因敲除模型构建

Bioinformatic Characterization and Knockout Model Generation of the Zebrafish cldn3d Gene

摘要目的 分析斑马鱼紧密连接蛋白3d(Cldn3d)的生物学特征及其在斑马鱼早期胚胎中的表达模式,构建斑马鱼cldn3d纯合子突变体,探究cldn3d在斑马鱼胚胎发育过程中的作用.方法 利用生物信息学分析不同物种间cldn3d基因的进化保守性及Cldn3d蛋白的跨物种同源性(包括斑马鱼、人类和小鼠等);采用CRISPR/Cas9技术构建稳定遗传的斑马鱼cldn3d缺失突变体,并通过基因组DNA测序确认突变类型;结合原位杂交检测突变体中 mRNA的表达,初步探讨cldn3d在斑马鱼胚胎肝脏早期发育中的作用.结果 斑马鱼cldn3d与人类CLDN3D基因同源,编码蛋白具有较高氨基酸序列同源性,成功构建可稳定遗传的cldn3d缺失突变体,导致编码区(CDS)终止密码子提前,产生截短蛋白.原位杂交结果显示,cldn3d在受精后48 h(48 hpf)至受精后第5天(5 dpf)阶段高表达于肝脏与肠道,4 dpf时集中于胆管.结论 斑马鱼cldn3d基因缺失突变体已成功构建,cldn3d突变虽不影响肝细胞分化,但cldn3d基因在斑马鱼发育过程中在肝脏、胆管和肠道高表达,提示该基因在肝脏、胆管和肠道的发育中可能发挥着重要作用.

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