换一批小鼠肝素酶H-2Kb限制性CTL表位预测及其MHC-I亲和力分析
Prediction of H-2Kb restricted CTL epitope of heparanase and affinity assay of these epitopes with MHC-I molecule
摘要目的 预测肿瘤转移相关基因肝素酶的CTL表位,为探索基于肝素酶的抗原表位的免疫治疗奠定基础.方法 利用基于超基序、量化基序结合人工神经网络方案开发的H-2Kb限制性CTL表位预测软件,对小鼠肝素酶蛋白的CTL表位进行预测,然后人工合成相关待测表位肽,再对这些合成肽与MHC-I结合亲和力进行检测.结果 采用机算机网络系统,预测了5条小鼠肝素酶抗原表位,即mHpa234～241(LGEDFVEL),mHpa351～358(FAAGFMWL),mHpa519 ～526(FSYGFFVI),mHpa386～393(VDENFEPL),mHpa398～405(LSLLFKKL),MHC亲合力实验表明,与阴性对照肽对比,随着预测肽浓度增加,H-2Kb的表达逐渐增加,与MHC-Ⅰ类分子的亲和力亦逐渐增强,当预测肽浓度达到30μmol/L时,其荧光系数(FI)均大于1.5.结论 通过计算机软件预测到的5条小鼠肝素酶CTL表位与MHC-Ⅰ类分子均有较高的结合亲和力,为该表位的下一步体内鉴定及基于小鼠肝素酶抗原表位的肿瘤免疫治疗奠定基础.
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