换一批果蝇Tap蛋白结构与功能的生物信息学分析
Bioinformatics analysis of the structure and function of Drosophila Tap protein
摘要目的 利用生物信息学方法分析果蝇Tap蛋白的结构和功能.方法 基于NCBI数据库中果蝇Tap蛋白的氨基酸序列,从蛋白质理化性质、跨膜区、信号肽、亚细胞定位、结构域、三维结构及物种间同源蛋白进化关系等方面进行分析.结果 Tap蛋白为不稳定亲水性蛋白,无跨膜区和信号肽,在细胞核中发挥生物学效应,具有碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)结构域.Tap蛋白与来源于NeuroD1的模板2ql2.1.B有61.02％的氨基酸序列一致,Tap蛋白与人类和啮齿动物的编码产物高度同源,在系统发生树中距离最近.结论 果蝇Tap蛋白具有bHLH蛋白家族的典型结构,可能在果蝇胚胎发育早期的神经发生、分化等过程中发挥作用.
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关键词
Tap蛋白螺旋-环-螺旋构型分子结构计算生物学果蝇,黑腹Tap proteinbasic helix-loop-helix motifsmolecular structurecomputational biologydrosophila melanogaster
医学主题词
蛋白(Egg White)计算生物学(Computational Biology)螺旋-环-螺旋构型(Helix-Loop-Helix Motifs)分子结构(Molecular Structure)方法(Methods)
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1671-8348.2015.17.003
发布时间
2015-08-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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