基于生物信息学分析GLIS3在胃癌中表达与免疫浸润的临床意义

Clinical significance of GLIS3 expression and immune infiltration in gastric cancer based on bioinformatics analysis

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摘要目的研究GLIS3在胃癌中的表达与预后价值,探索GLIS3在胃癌中免疫细胞浸润情况及其参与的生物学功能.方法从TCGA数据库中下载胃癌患者GLIS3基因表达谱数据及临床病理信息,比较胃癌组织和癌旁组织中GLIS3的表达差异,分析GLIS3表达与胃癌患者临床病理特征的关系.利用Kaplan-Meier法和Cox回归分析GLIS3表达与胃癌患者临床预后相关性.运用miRWALK、TargetScan及TCGA数据库,预测调控GLIS3异常表达的miRNA.利用GSEA富集分析预测GLIS3在胃癌中可能参与的信号通路.使用TIMER2.0分析GLIS3表达与免疫细胞浸润之间的关系.结果 GLIS3在胃癌组织中表达明显上调,且GLIS3的表达与肿瘤组织学分级相关(P＜0.05).生存分析显示GLIS3高表达患者比低表达患者预后更差,差异有统计学意义(P＜0.05),是胃癌的独立预后因素(HR=1.288,95％CI:1.004～1.653,P＜0.05).miR-204-5p在胃癌中表达明显下调,且与GLIS3表达负相关(P＜0.05).富集分析结果显示:GLIS3基因主要富集在细胞外基质(ECM)受体相互作用、钙、黏着斑等信号通路.免疫浸润分析结果显示GLIS3表达与CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞相关(P＜0.05).结论 GLIS3在胃癌中表达上调,可作为胃癌的诊断和预后的标志物,且与免疫浸润有关.