• 医学文献
  • 知识库
  • 评价分析
  • 全部
  • 中外期刊
  • 学位
  • 会议
  • 专利
  • 成果
  • 标准
  • 法规
  • 临床诊疗知识库
  • 中医药知识库
  • 机构
  • 作者
热搜词:
换一批
论文 期刊
取消
高级检索

检索历史 清除

医学文献>>
  • 全部
  • 中外期刊
  • 学位
  • 会议
  • 专利
  • 成果
  • 标准
  • 法规
知识库 >>
  • 临床诊疗知识库
  • 中医药知识库
评价分析 >>
  • 机构
  • 作者
热搜词:
换一批

基于生物信息学分析急性心肌梗死的差异基因及预测潜在治疗药物

Bioinformatics-based analysis of differential genes and prediction of potential therapeutic agents in acute myocardial infarction

摘要目的 筛选急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)的核心基因,并预测相应基因的潜在治疗药物.方法 从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载数据集GSE24519与GSE66360,筛选AMI与正常对照组的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,通过String、Cytoscape构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,应用cytoHubba插件筛选出核心基因,并与DGIdb数据库相映射,揭示尚未被充分挖掘的、可能用于治疗AMI的药物靶点及潜在药物候选.结果 2 组数据集中共有 43 个基因被鉴定为交集DEGs(P<0.05),包括 33 个上调基因,10 个下调基因;GO分析生物过程主要富集在细胞分化、细胞群增殖的正调控、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinases,MAPK)活性的负调控、细胞因子产生的正调控等;KEGG通路富集分析显示DEGs主要参与了晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体信号通路、MAPK信号通路等.通过cytoHubba筛选获得5个核心基因(RGS2、DUSP1、JUN、LRRK2、TNFAIP6),用DGIdb数据库预测这些基因相对应的潜在治疗药物,共获得了 87 个药物或化合物.其中RGS2、DUSP1、JUN及LRRK2 分别获得 1、15、46 和 25 个药物或化合物,而TNFAIP6并未被预测到相应治疗药物.结论 RGS2、DUSP1、JUN、LRRK2、TNFAIP6 是AMI发生发展的核心基因;基于数据库预测的靶向DUSP1 的羟基脲、伊马替尼,靶向JUN的秋水仙碱以及靶向LRRK2 的帕博西尼等药物在治疗AMI方面具有潜在的治疗价值.

更多
广告
作者 郑燕钗 [1] 王育婷 [2] 王凌 [3] 学术成果认领
作者单位 福建省福州市长乐区人民医院 药剂科,福建 福州 350200 [1] 福建医科大学药学院,福建 福州 350108 [2] 福州大学附属省立医院药学部,福建 福州 350001 [3]
栏目名称
DOI 10.16746/j.cnki.11-9332/r.2024.03.007
发布时间 2024-12-13
  • 浏览2
  • 下载1
创伤与急诊电子杂志

加载中!

相似文献

  • 中文期刊
  • 外文期刊
  • 学位论文
  • 会议论文

加载中!

加载中!

加载中!

加载中!

特别提示:本网站仅提供医学学术资源服务,不销售任何药品和器械,有关药品和器械的销售信息,请查阅其他网站。

  • 客服热线:4000-115-888 转3 (周一至周五:8:00至17:00)

  • |
  • 客服邮箱:yiyao@wanfangdata.com.cn

  • 违法和不良信息举报电话:4000-115-888,举报邮箱:problem@wanfangdata.com.cn,举报专区

官方微信
万方医学小程序
new翻译 充值 订阅 收藏 移动端

官方微信

万方医学小程序

使用
帮助
Alternate Text
调查问卷