基于网络药理学及分子对接技术探究巴戟天治疗心肌梗死的作用机制
Exploring the mechanism of active components of Morinda officinalis in treating myocardial infarction based on network pharmacology and molecular docking
摘要目的 通过网络药理学方法及分子对接技术探索巴戟天治疗心肌梗死(myocardial infarction,MI)的主要活性成分、靶点及潜在作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库及SwissTargetPrediction数据库获取巴戟天活性成分及其靶点,使用GeneCard平台和DisGeNET数据库以及OMIM数据库检索MI的作用靶点.将活性成分与疾病的交集靶点通过STRING在线平台进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,并使用Cytoscape软件进一步构建成分-靶点调控网络.通过基因本体论(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,挖掘出巴戟天治疗MI的分子靶点和相关通路,最后将PPI筛选得到的核心靶点与巴戟天主要活性成分进行分子对接验证.结果 巴戟天活性成分共筛选得到 277 个靶点,MI疾病靶点共 1040 个,合并后得到 71 个交集靶点,经PPI分析得到相互作用的关键靶点 32 个,排名前 5 的核心靶点为:AKT1、PPARG、PTGS2、ESR1、PIK3CG.GO分析结果显示,巴戟天治疗MI主要涉及蛋白质分解、磷酸化、细胞对缺氧的反应、锌离子结合、内肽酶活性等过程;KEGG富集结果显示核心靶点主要富集在脂质代谢及动脉粥样硬化、cGMP-PKG、IL-17等信号通路;分子对接结果显示β-谷甾醇、1-羟基-2-甲氧基蒽醌与核心靶点AKT1、PPARG、PTGS2 可以稳定结合,结合能均小于﹣6kcal/mol.结论 巴戟天中β-谷甾醇、1-羟基-2-甲氧基蒽醌等化学成分可能通过调控AKT1、PPARG、PTGS2等靶基因的表达,调节脂质代谢及动脉粥样硬化、cGMP-PKG、IL-17等多个信号通路,从而发挥治疗MI的作用.
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