换一批
换一批摘要从假交替单胞菌（Pseudoalteromonas sp. DL-6）中克隆低温几丁质酶chiA基因（GenBank登录号KF234015）。该序列全长3160个核苷酸，编码1053个氨基酸，预测相对分子质量113.5 KDa，等电点（pI）4.49，命名为chiA。功能结构域分析显示其编码区包含信号肽、2个几丁质结合域、2个成人多囊肾病结构域、18家族几丁质酶催化域与18家族糖苷水解酶C端部分序列。利用Discovery Studio平台以同源建模的方法构建低温几丁质酶chiA的催化域三维结构模型，并对其进行结构优化和评估，Ramachandram图谱检测和Verify-3D评估显示模拟出的模型结构合理，整体的相容性较为可信。本结果拟为后期低温几丁质酶chiA的催化机理研究提供理论依据。
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关键词
低温几丁质酶chiA假交替单胞菌同源模建序列分析cold-adapted chiAPseudoalteromonas sp. DL-6homology modelingsequence analysis
栏目名称
生命科学与技术
DOI
10.3969/j.issn.1008-2395.2015.06.014
发布时间
2016-03-22
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