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马氏珠母贝α-Tubulin基因结构、SNP筛选及耐低温相关性分析

α-Tubulin gene structure,SNP screening and its correlation with low temperature tolerance in the pearl oyster(Pinctada fucata martensii)

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摘要为了探究马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)α-Tubulin基因在低温适应性中的作用,通过RACE克隆技术获得马氏珠母贝α-Tubulin基因,分析了α-Tubulin基因在低温胁迫下的表达趋势,并筛选和比较了马氏珠母贝耐低温选育系(R)F3 和北部湾野生群体(W)的 α-Tubulin 编码区 SNP 位点.结果表明:马氏珠母贝α-Tubulin基因总长为 2107 bp,可编码 454 个氨基酸,具有典型的Tubulin和Tubulin-C结构域;全组织定量显示,α-Tubulin基因在所有组织中均有表达,在足部中表达量最高(P<0.05);低温胁迫时,鳃组织中α-Tubulin基因在低温组(12、17℃)的表达量均在 72 h时达到最高,且显著高于对照组(22℃)(P<0.05);α-Tubulin外显子区域共有34 个SNP,其中3 个SNP位点的基因型频率在R和W群体间有显著性差异(P<0.05);连锁不平衡分析显示,R群体单倍型CCTCAGCGCC的频率明显高于W群体.研究表明,α-Tubulin为参与调节马氏珠母贝低温适应过程中的候选基因,筛选出的与抗低温性状相关的SNP位点g.111071125 及优异单倍型CCTCAGCGCC,可作为选择育种的候选标记.

作者刘雅 ^[1] 李松谕 ^[2] 赖卓欣 ^[3] 钟如卓 ^[3] 王庆恒 ^[4] 邓岳文 ^[4] 学术成果认领

作者单位湛江中心人民医院湛江市临床医学研究所, 广东湛江 524000;广东海洋大学水产学院, 广东湛江 524088 ^[1] 湛江中心人民医院湛江市临床医学研究所, 广东湛江 524000 ^[2] 广东海洋大学水产学院, 广东湛江 524088 ^[3] 广东海洋大学水产学院, 广东湛江 524088;广东省珍珠科技创新中心, 广东湛江 524088 ^[4]

关键词马氏珠母贝 α-Tubulin基因 SNP 低温耐受 Pinctada fucata martensii α-Tubulin gene SNP low temperature tolerance

分类号 S917.4

栏目名称

研究论文

DOI 10.16535/j.cnki.dlhyxb.2022-264

发布时间 2023-07-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

基金项目

广东省教育厅重点领域专项（2020ZDZX1045）广东省自然科学基金项目（2020A151501691）广东省现代农业产业技术体系-贝藻类产业创新团队（KJ146）