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Differential methylation analysis for bisulfite sequencing using DSS

摘要Bisulfite sequencing (BS-seq) technology measures DNA methylation at single nucleotide resolution.A key task in BS-seq data analysis is to identify differentially methylation (DM) under different conditions.Here we provide a tutorial for BS-seq DM analysis using Bioconductor package DSS.DSS uses a beta-binomial model to characterize the sequence counts from BS-seq,and implements rigorous statistical method for hypothesis testing.It provides flexible functionalities for a variety of DM analyses.

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作者单位 Department of Population and Quantitative Health Sciences, Case Western Reserve University, Cleveland, OH 44106, USA [1] Department of Biostatistics and Bioinformatics, Emory University Rollins School of Public Health, Atlanta, GA 30322, USA [2]
栏目名称 PROTOCOL AND TUTORIAL
发布时间 2020-04-29
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定量生物学(英文版)

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