换一批RNA G-四联体结构区的同义密码子进化选择
Evolutionary selection on synonymous codons in RNA G-quadruplex structural region
摘要为探索同义密码子对RNA G-四联体(rG4)形成的适应效应,利用G4 Hunter算法搜寻5类真核生物mRNA蛋白编码区的rG4结构.通过对比天然序列和随机序列,评估rG4结构对同义密码子的选择偏好,分析影响rG4形成的因素,检验基因特定区域rG4结构的选择压力,以揭示rG4在基因调控中的潜在作用.结果 表明,在5类真核生物中,rG4结构区内的同义密码子普遍受到促使rG4形成的选择压力.在rG4结构区内的蛋白编码序列倾向于使用富含鸟嘌呤的密码子组合,不倾向于选择富含胞嘧啶的密码子组合.密码子使用偏好、碱基成分以及进化速率等因素和rG4对同义密码子的选择压力具有相关性.基因翻译起始区的序列受到更强的促使rG4结构形成的选择压力.
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关键词
RNA结构G-四联体同义密码子进化选择ribonucleic acid (RNA) structureG-quadruplexsynonymous codonsevolutionselection
分类号
Q311（遗传与变异）
DOI
10.3969/j.issn.1003-7985.2021.02.007
发布时间
2021-07-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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