抗原特异TCRα和β链基因克隆及分子空间结构预测

Cloning of antigen-specific TCR α and β genes and their 3-D structure prediction

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摘要目的扩增弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma,DLBCL)相关抗原特异T细胞克隆的全长TCR α和β链基因序列,并对其三维空间结构进行预测.方法从已鉴定的2例伴有克隆性增殖TCR Vα6和Vβ13亚家族T细胞的DLBCL患者外周血中克隆全长TCR α和β基因序列,利用Primer Premier 5.0分析软件推算其相应的氨基酸序列,并通过自动化蛋白质模建服务器SWISS-MODEL进行三维空间结构预测.然后利用蛋白质三维图像分析软件Rasmol 对所获得的TCR三维空间结构进行显示和分析.结果获得DLBCL相关抗原特异TCR α6和β13全长基因序列及其氨基酸序列.2例患者的TCR Vα6的空间结构与PDB ID:3ffcD模型相似,序列同源性分别为92.16%和91.71%;而2个TCR Vβ13也均具有同一个空间结构模型PDB ID:2ialD,序列同源性分别为92.95%和92.18%.结论来自不同DLBCL患者外周血中克隆性增殖的TCR Vα6或Vβ13亚家族T细胞的TCR具有高度同源性的空间结构,提示其可能识别相同的肿瘤抗原表位.

作者尹青松 ^[1] 谭获 ^[2] 陈少华 ^[3] 杨力建 ^[3] 李萡 ^[3] 叶静梅 ^[2] 李扬秋 ^[4] 学术成果认领

作者单位 450008,郑州,河南省肿瘤医院;510632,广州,暨南大学,医学院血液病研究所 ^[1] 广州医学院第一附属医院肿瘤血液中心,广州,510260 ^[2] 暨南大学,医学院血液病研究所,广州,510632 ^[3] 510632,广州,暨南大学,医学院血液病研究所;510632,广州,暨南大学再生医学教育部重点实验室 ^[4]

关键词 T细胞受体 CDR3区同源建模弥漫大B细胞淋巴瘤

主题词细胞(Cells)基因(Genes)抗原(Antigens)预测(Forecasting)淋巴瘤(Lymphoma)

分类号 R394-33 R392.12 R394.3

发布时间 2011-05-03

基金项目

国家高技术研究发展计划（863 Program;2006AA02Z114）；广东自然科学基金重点项目（05103293;9251063201000001）