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胃黏膜高级别上皮内瘤变组织的增强子重塑及其对增殖相关基因CD24表达的影响

Remodeling of enhancers in high-grade epithelial dysplasia of gastric mucosa and its effect on expression of proliferation-related gene CD24

摘要目的 通过绘制胃黏膜高级别上皮内瘤变(high-grade intraepithelial neoplasia,HGIN)组织中组蛋白H3K27ac修饰标记的增强子图谱,探究表观调控对HGIN发生发展的影响.方法 收集2022年6月至2023年6月来自陆军特色医学中心消化内科的14例正常胃黏膜组织(Nor组)、31例胃黏膜高级别上皮内瘤变组织(HGIN组)和17例胃癌(gastric cancer,GC)组织(GC组),利用染色质靶向捕获测序(cleavage under targets and tagmentation,CUT&Tag)技术捕获组蛋白H3K27ac修饰的增强子区域;联合多组学分析筛选HGIN组织特异的活性增强子及其潜在调控的基因;采用免疫组化染色观察目的基因在不同类型临床样本中的表达差异,并通过CRISPR-dCas9基因编辑技术沉默活性增强子,观察目的基因的表达水平,并验证潜在调控关系.结果 表观多组学测序数据质量较好,3组样本组间H3K27ac修饰的全基因组分布特征无显著差异,但H3K27ac增强子在HGIN、GC组织中发生明显重塑(P<0.05).联合转录组数据分析发现,增强子重塑可能上调HGIN组织增殖相关靶基因CD24表达;抑制增强子活性,则CD24表达水平显著降低(P<0.05).免疫组化结果显示,CD24表达与Ki-67呈正相关(P<0.001).结论 H3K27ac标记的增强子重塑是HGIN的重要表观遗传学特征,H3K27ac标记的活性增强子上调CD24表达,可能促进HGIN增殖.

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作者 薛锐 [1] 潘雨薇 [2] 谭玉婷 [2] 储召乐 [3] 刘碧颖 [3] 李先锋 [3] 王涛 [3] 王斌 [4] 张璇 [5] 沈艾 [6] 学术成果认领
作者单位 重庆大学医学院,重庆;重庆大学附属肿瘤医院肝胆胰肿瘤中心,重庆 [1] 重庆大学医学院,重庆 [2] 陆军特色医学中心(第三军医大学大坪医院)消化内科,消化系统肿瘤精准防治重庆市重点实验室,重庆 [3] 重庆大学医学院,重庆;陆军特色医学中心(第三军医大学大坪医院)消化内科,消化系统肿瘤精准防治重庆市重点实验室,重庆 [4] 重庆市中医院肿瘤科,重庆 [5] 重庆大学附属肿瘤医院肝胆胰肿瘤中心,重庆 [6]
DOI 10.16016/j.2097-0927.202408113
发布时间 2025-03-19(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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陆军军医大学学报

陆军军医大学学报

2025年47卷5期

426-434页

ISTICPKUCSCDCA

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