换一批
换一批基于生信分析玫瑰痤疮毛细血管增生相关关键基因的筛选
Screening of key genes related to angiogenesis in rosacea based on bioinformatics analysis
摘要目的 利用生物信息学方法分析玫瑰痤疮(rosacea,RA)毛细血管增生相关差异表达基因,筛选关键基因并验证其在RA中的表达水平.方法 从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)获取基因芯片数据集GSE65914,应用R语言分析得到与RA相关的差异表达基因,并与GeneCards数据库中的血管增生相关基因取交集,获得RA血管增生相关基因,进一步基于蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析及Cytoscape算法筛选关键基因.建立RA小鼠模型,通过RT-qPCR验证以上关键基因在RA皮损组织中的mRNA表达水平.结果 从GEO中分析获得947个RA相关差异表达基因,进一步获得202个RA血管增生相关基因,最终筛选出具有显著差异的三个关键基因CXCL8、IL-1B、STAT1.RT-qPCR结果表明,MIP-2、GCP-2、IL-1B、STAT1在RA皮损中的mRNA表达水平显著高于正常对照(P<0.05).结论 本研究通过生物信息学方法筛选并验证了RA血管增生的关键基因CXCL8、IL-1B和STAT1,为揭示RA血管增生可能机制及研究靶向治疗方案提供了理论依据.
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10.16016/j.2097-0927.202502047
发布时间
2025-04-21
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