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染色质可及性重塑上调节律因子NPAS2表达促进胃癌铁死亡抵抗的作用研究

Accessible chromatin upregulates circadian rhythm transcription factor NPAS2 to promote Ferroptosis Resistance in Gastric Cancer Cells

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摘要目的探索表观重塑调控生物钟基因对胃癌细胞铁死亡的影响.方法整合分析染色质可及性测序(assay for Transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing,ATAC-seq)、组织转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)及单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)数据,从染色质可及性调控癌细胞基因表达的角度,筛选发现胃癌开放染色质可能招募与生物节律相关的关键转录因子NPAS2.胃癌组织免疫组化染色和生存分析发现NPAS2高表达与胃癌进展和临床预后相关.调控功能方面,生物信息学分析提示节律因子NPAS2与铁死亡通路显著相关;构建敲低及过表达NPAS2胃癌细胞株,结合CCK-8、丙二醛(malondialdehyde,MDA)含量测定、BODIPY荧光染色及流式细胞术等功能实验,证实NPAS2对胃癌细胞铁死亡的抑制作用.结果昼夜节律转录因子NPAS2在胃癌进展中 mRNA和蛋白水平表达量均显著上升,且其高表达与患者不良预后密切相关.NPAS2高表达与铁死亡通路失活相关,NPAS2高表达会使胃癌组织中多个铁死亡抑制基因(如SLC7A11、ACSL3)表达显著升高.细胞生物学实验表明,在胃癌细胞中过表达NPAS2增强铁死亡抵抗能力,敲低NPAS2则促进细胞发生铁死亡.结论胃癌中开放染色质可上调节律因子NPAS2,其通过赋予胃癌细胞铁死亡抵抗特性促进肿瘤进展,是潜在的治疗靶点.

作者李雅萍 ^[1] 胡晓 ^[1] 秦紫芸 ^[2] 张巧巧 ^[3] 储召乐 ^[4] 周智利 ^[3] 王斌 ^[5] 邱秋 ^[6] 学术成果认领

作者单位重庆大学医学院,重庆;金凤实验室,重庆 ^[1] 金凤实验室,重庆;西南大学医学研究院,重庆 ^[2] 金凤实验室,重庆 ^[3] 金凤实验室,重庆;西南大学药学院,重庆 ^[4] 金凤实验室,重庆;陆军军医大学大坪医院消化内科,消化系统肿瘤精准防治重庆市重点实验室 ^[5] 重庆市合川区人民医院消化内科,重庆 ^[6]

关键词胃肿瘤染色质重塑铁死亡人NPAS2蛋白昼夜节律 stomach neoplasms chromatin assembly and disassembly ferroptosis NPAS2 protein,human circadian rhythm

分类号 R394.3（医学遗传学）R730.23（肿瘤学一般性问题）R735.2（消化系肿瘤）

栏目名称

基础医学

DOI 10.16016/j.2097-0927.202509102

发布时间 2026-01-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）