摘要目的 系统揭示胃癌不同转录元程序(meta-program,MP)的肿瘤微环境特征及其空间互作单元,探讨其潜在临床意义.方法 整合分析 2 个胃癌单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)数据集,鉴定恶性细胞转录MP.在胃癌转录组[癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)]或芯片队列(GSE15459、GSE66229)中验证MP的预后价值.利用scRNA-seq解析在不同MP背景下微环境中特征性细胞亚群的组成差异,推断关键的配体-受体对话机制.结合空间转录组验证上述细胞亚群和配体-受体的共定位.在上述转录组/芯片队列中评估关键细胞特征基因集及互作分子的表达水平与患者总生存期的关系.结果 在胃癌恶性细胞中,鉴定出4类转录元程序(MP1～MP4),其中MP2和MP4的高表达与患者不良预后显著相关(P<0.05).在MP2高表达样本中,SPP1+巨噬细胞显著富集,且该细胞与T3中性粒细胞通过SPP1-CD44配体-受体对进行细胞互作,空间转录组进一步证实二者在组织中存在共定位.SPP1+巨噬细胞特征(P=0.007)及SPP1-CD44联合特征(P=0.008)均与患者不良预后显著相关.在MP4高表达样本中,肌成纤维细胞(myofibroblastic cancer-associated fibroblast,myCAF)显著富集,其与耗竭性CD8+T细胞经由COL6A家族-ITGB1信号轴相互作用,空间转录组进一步证实二者在组织中存在共定位.myCAF特征(P=0.001)及COL6A家族-ITGB1联合特征(P<0.001)均与患者不良预后显著相关.结论 在胃癌中MP2和MP4分别关联于SPP1+巨噬细胞-T3中性粒细胞和myCAF-耗竭性CD8+T细胞这两个免疫抑制性空间互作单元,二者可能分别通过SPP1-CD44和COL6A家族-ITGB1信号轴驱动胃癌进展,为精准免疫治疗提供了潜在靶点.