换一批
换一批扬子鳄MHCⅡ类B基因第二外元的克隆及序列分析
Cloning and Sequences Analysis of the Second Exon of MHC Class Ⅱ B Genes in Chinese Alligator,Alligator sinensis
摘要3头扬子鳄血样取自宣城安徽省扬子鳄繁殖研究中心.利用一对简并引物对MHC Ⅱ类B基因第二外元的部分片段进行扩增;通过克隆、单链构象多态性分析、测序,并将测得序列与下载的8个物种MHC序列比对,确定序列差异和变异位点;利用MEGA软件构建NJ树,PAUP4.0构建MP树.结果得到10种不同的序列,片段长166bp.核苷酸序列中有38个变异位点,氨基酸序列中有23个变异位点;推定的抗原结合位点非同义替换(dN)明显高于同义替换(dS).10种序列的NJ树和MP树极为相似,均为A、B两个分支,两个分支明显的特异性位点核苷酸序列中有9个,氨基酸序列中有7个.表明扬子鳄MHC Ⅱ类B基因第二外元有较高的多态性,有利于扬子鳄饲养种群的遗传保护.
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分类号
Q959.64
栏目名称
研究论文
DOI
10.3321/j.issn:0254-5853.2004.05.008
发布时间
2004-11-24
基金项目
国家自然科学基金
安徽省自然科学基金
安徽省优秀青年科研项目
安徽省重点实验室基金
安徽省学术技术带头人科研项目
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