常用系统发育树构建算法和软件鸟瞰
A bird's eye view of the algorithms and software packages for reconstructing phylogenetic trees
摘要系统发育树又称进化树、生命树等,在达尔文的“进化论”一书中首次出现,之后系统发育树的重构被广大生物学家所接受.该文阐述了构建系统发育树的基本流程,对目前用于构建系统发育树的四类算法(距离法、最大简约法、最大似然法和贝叶斯法)进行了详细地分析和比较,并介绍了一些常用系统发育树构建和分析软件(PHYLIP、MEGA、MrBayes)的特点.
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关键词
系统发育树距离矩阵法最大简约法最大似然法贝叶斯算法系统发育分析软件Phylogenetic treeDistance matrixMaximum parsimonyMaximum likelihoodBayesian frameworkPhylogenetic analysis software
分类号
Q332(人工选择与自然选择)
栏目名称
DOI
10.11813/j.issn.0254-5853.2013.6.0640
发布时间
2014-01-19(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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