用细胞色素b部分序列研究斑马鱼的分子分类与系统发育
The Molecular Taxonomy and Phylogeny of Zebrafish(Danio rerio) Based on the Cyt-b Partial Sequences
摘要用细胞色素b特异性引物,对长尾斑马鱼、短尾斑马鱼、豹纹斑马鱼、食蚊鱼和青石斑鱼的总DNA进行PCR扩增、克隆、测序后与Genbank数据库的团头鲂、青鳉鱼、草鱼、金桔鱼的细胞色素b基因同源序列进行序列比较.结果显示,长度为426 bp的细胞色素b同源序列的平均碱基组成是:26.7% A,26.1%C,16.6%G,30.5%T,密码子第三位点的碱基组成存在较大的偏倚,G的含量仅占6.4%.长尾斑马鱼、短尾斑马鱼和豹纹斑马鱼之间细胞色素b DNA序列变异很小,相似性高于99%.NJ法构建的分子系统树表明:豹纹斑马鱼先与长尾斑马鱼聚在一起,再与短尾斑马鱼聚为一组.本研究结果支持Frankel和David等人认为豹纹斑马鱼应该是Danio rerio的一个亚种,而不是单独的一个种的观点.
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