吉富罗非鱼IGF2基因分离及其单核苷酸多态性与体型、增重相关性
Isolation of IGF2 Gene and Correlation of Its SNPs with Fish Sharp and Weight Gain in GIFT Strain Nile Tilapia Oreochromis niloticus
摘要胰岛素样生长因子2(insulin-like growth factor 2,IGF2)是控制动物生长和脂肪沉积的重要基因之一.本文采用PCR方法分离了吉富罗非鱼(GIFT strain Nile tilapia Oreochromis niloticus),GF2基因5 475bp,包含由4个外显子组成的整个阅读框669 bp以及3个内含子.通过比对吉富罗非鱼10个个体IGF2序列,共发现11处单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,本文检测了内含子1的621 nt(C/T)和外显子3的161 nt(A/G)两位点在192尾吉富罗非鱼中的基因型分布.并分析不同基因型与体型、增重的相关性.使用四引物扩增受阻体系PCR检测内含子1的621 nt基因型,结果显示,CC、CT、TT基因型频率在雄鱼中分别为0.32、0.32、0.36,在雌鱼中分别为0.38、0.38、0.24;与体型、增重的相关性分析表明,此位点不同基因型只与雄鱼体型(体高/体长)显著相关(P<0.05),CC型个体显著高于CT和TT型个体.外显子3的A/G转换导致了.MSP I酶切位点改变,使用PCR-RFLP法检测该位点基因型.结果显示整个群体中不存在AA基因型,在雄鱼中,GG、AG基因型频率分别为0.71、0.29,而雌鱼中则为0.75和0.25;与体型、增重的相关性分析表明,此位点不同基因型只与雄鱼增重极显著相关(P<0.01),GG型的雄鱼明显较AG型增重快.
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