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哺乳动物BMP4蛋白功能位点的进化踪迹分析

Evolutionary Trace Analysis of Functional Sites of the BMP4

摘要哺乳动物骨形态发生蛋白(BMPs)具有促进动物软骨形成,调节细胞增殖、分化及迁移的多种功能.此外,该蛋白在动物个体发育及人(Homo sapiens)肿瘤的发生、发展过程中也扮演着重要角色.本文以人源骨形态发生蛋白4 (BMP4)为种子序列,利用多种生物信息学工具进行哺乳动物BMP4蛋白的序列查找及其同源蛋白的搜索,共得到具有完整结构域的同源蛋白序列72条,并以此为基础对哺乳动物BMP4的进化踪迹位点及相关的功能位点进行比较研究.结果表明,BMP4蛋白家族的TGFβ-propeptide结构域具22个全家族保守残基,而TGF-β结构域仅具84个亚家族特异性残基.人BMP4蛋白TGF-β结构域的配基结合位点主要分布于结合口袋的边缘区域.本研究可为BMP4蛋白重要功能区残基的确定及未知功能位点的预测提供信息.

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动物学杂志

动物学杂志

2015年50卷1期

21-30页

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