摘要为了解鲽科鱼类ITS2序列的多态性特征,本研究获得了鲽科10种鱼类310条ITS2序列,长度在419 ～ 486 bp之间.种内序列长度差异最小的为粒鲽(Clidoderma asperrima)(419 ～ 420 bp)和太平洋拟庸鲽(Hippoglossoides elassodon)(419 ～ 420 bp),其次为北岩鲽(Lepidopsetta polyxystra)(447～ 452 bp)和刺黄盖鲽(Limanda aspera)(457 ～ 463 bp),松木高眼鲽(Cleisthenes pinetorum)(452 ～ 462 bp)和圆斑星鲽(Verasper variegatus)(465 ～ 479 bp)的种内序列差异分别为10 bp和14 bp;其余4种鱼类根据长度差异(14 ～ 32 bp)分型为长(A型)、短(B型)序列类型,同时检测存在重组类型(R型),其中长度差异最大的是钝吻黄盖鲽(Pseudopleuronectes yokohamae)(454 ～ 486 bp),其次为尖吻黄盖鲽(P. herzensteini)(433 ～ 458 bp)、虫鲽(Eopsetta grigorjewi)(420 ～ 439 bp)、星突江鲽(Platichthys stellatus)(466 ～ 480 bp).通过双参数模型(K2P)计算遗传距离可见,种内遗传距离多集中于0.002 ～ 0.027之间,仅星突江鲽和尖吻黄盖鲽因类型差异导致较高数值(0.043和0.053);不同物种间遗传距离在0.046 ～ 0.180之间.10种鱼类ITS2的GC含量为63.95％ ～ 70.16％;9种鱼类的二级结构均为具有5个分支(HelixⅠ ～ Ⅴ)的闭合环状结构,仅圆斑星鲽中由于存在Helix Ⅳ变异形成Helix Ⅳ-a和Helix Ⅳ-b而具有6个分支.基于ITS2构建的鲽科10种鱼类的系统进化树显示,不同种鱼类的克隆序列均单独聚支.序列的多态性特征分析表明,在具有不同序列类型的虫鲽、星突江鲽、尖吻黄盖鲽和钝吻黄盖鲽4种鲽科鱼类中,ITS2以非协同进化的方式存在,而其他6种鱼类为协同进化;虽然存在种间K2P遗传距离小于种内的个例,但ITS2在属间不同物种的区分上具有适用性.本研究结果丰富了鲽形目鱼类的ITS2数据,也将为鱼类的核糖体RNA序列多态性的研究提供科学依据.