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山羊地方性鼻内腺瘤病毒和内源性逆转录病毒gag变异区的克隆与分析

Cloning and Sequence Analysis of gag Variable Region of Enzootic Nasal Tumor Virus and Endogenous Retrovirus of Goats

摘要根据病毒gag变异区的两端设计引物,PCR扩增ENTV及ERVs的gag变异区,TA克隆并测序,经比对分析发现,在ERVs的783位~803位的"CCT"重复序列,编码多聚脯氨酸"PPPPPPP",对应在ENTV gag中存在缺失突变和点突变,编码氨基酸为"PSL",生物信息学预测该区域的变异位于一个重要的抗原决定簇中,对gag在ENTV和ERVs中的功能有较大影响,为进一步研究gag的抗原性及相关免疫学检测方法的建立奠定基础.

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