A型产气荚膜梭菌青海分离株tetA(P)耐药基因序列分析及蛋白结构预测
Sequence Analysis and Protein Structure Prediction of tetA(P) Resistance Gene of Clostridium perfringens Type A Qinghai Isolate
摘要应用PCR技术对A型产气荚膜梭菌青海分离株的tetA(P)耐药基因进行扩增、测序,利用生物软件对tetA(P)基因进行序列分析与蛋白结构预测.结果表明,A型产气荚膜梭菌青海分离株的tetA(P)基因长度为1 263 bp,编码420个氨基酸.与参考菌株EHE-NE18、Wakayama、CW92的核苷酸序列同源性依次为100%、99.8%和98.7%,氨基酸序列同源性依次为100%、100%和98.3%.分离株TetA (P)蛋白疏水性较强,具有10个跨膜区,含有4个N-糖基化位点,1个cAMP和cGMP依赖性蛋白激酶磷酸化位点,5个蛋白激酶C磷酸化位点,1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,1个酪氨酸激酶磷酸化位点,12个N-豆寇酰化位点,三级结构主要是由α-螺旋和无规则卷曲形成.研究结果可为A型产气荚膜梭菌tetA(P)基因功能研究提供依据.
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